تبدا رحلة حفظ المخطوطة من استلام وحدة المخطوطات بعمادة شؤون المكتبات للمخطوطة من خلال لجنة مختصة بالمخطوطات.

عملية تسجيل و وصف البيانات الأساسية للمخطوطة كالعنوان والمؤلف وتاريخ النسخ.

عملية تحويل المخطوطة الورقية إلى صورة رقمية باستخدام ماسحات ضوئية متخصصة، تهدف هذه العملية للحفاظ على المخطوطة الأصلية.

عملية تعقيم المخطوطة تكون داخل أجهزة تعقيم خاصة، تهدف عملية التعقيم للقضاء على الحشرات غير المرئية بالعين المجردة والتي تتغذى على أوراق المخطوطة.

عملية إزالة الأتربة والحشرات الموجودة على سطح المخطوطة بعد عملية التعقيم.

عملية ترقيم الصفحات تتم بعد الانتهاء من التعقيم والتنظيف الجاف للمخطوطة وقبل عملية فك المخطوطة، تهدف عملية ترقيم صفحات المخطوطة لمنع تداخل أوراق المخطوطة بعد فكها وإمكانية اعادتها كما كانت عليه.

ليتمكن الفني بالتحكم بالأرواق قبل عملية الكيمائية.

إزالة الحموضة بالمحاليل المناسبة مع ضمان عدم اذابة الحبر.

يتم من خلال أوراق خاصة لتقوية أطراف صفحات المخطوطة وإعادة الأجزاء الممزقة منها.

يتم جمع المخطوطة بعد الانتهاء من معالجتها وترميمها.

يتم خياطة المخطوطة من خلال خيوط خاصة لأوراق المخطوطة وتجليدها تجليد يتناسب مع حالتها الفنية.

 يتم حفظ المخطوطة بخزانات خاصة مجهزة (الحرارة و الرطوبة) وذلك لحفظها من العوامل التي تؤثر على سلامة المخطوطة.